ד"ר אפרים אסכולאי עבד בוועדה לאנרגיה האטומית של ישראל (IAEC) (IAEA) (CTBT). בשנת שבתון במכון למדע ולביטחון בינלאומי (ISIS) Verification Revisited: The Nuclear Case , אשר ראה אור בהוצאת מכון ISIS .

ד"ר אסכולאי פרש מהשירות הציבורי ב-2001 ובשנת 2002 הצטרף למרכז יפה למחקרים אסטרטגיים (קודמו של INSS), משם פרש ב-2017 כחוקר בכיר (אמריטוס), אך המשיך לפרסם במסגרת המכון. ד"ר אסכולאי פרסם מאמרים רבים העוסקים באי-הפצתו של נשק להשמדה המונית (WMD) (Ph.D) .